组合式质谱仪，体现了多种先进的技术，包括它的质量分析器几何学、特有的信号处理技术、改善离子束到Orbitrap质量分析器传输效率的全新离子转移光学系统，以及新的镜像电流前置放大器。这些功能与新的离子阱技术相结合能提高整个系统的定量性能，加快分析速度并增加运行时间。这些特有的创新相结合能提供：

　　1、较大化的分辨能力；

　　2、提高了定量结果的精度度和可信度，而且增强了与UHPLC的兼容能力；

　　3、高品质的更高能量碰撞诱导解离（HCD）质谱图和FTMSn谱图裂解树能得到可靠的结构鉴定结果；

　　4、超高的灵敏度能检测极低丰度的蛋白质、肽和代谢物。

　　为综合性蛋白质组学研究提供新的可能：

　　对于Top-Down的蛋白质鉴定，组合式质谱仪超高的分辨率和灵敏度能帮助实验室提高完整蛋白质分子量的测量水平。采用互补的碎裂技术，如碰撞诱导解离、电子转移解离和高能碰撞诱导解离时，该系统还可以获得更高的蛋白质序列覆盖率。这些特征还能为突变和翻译后修饰的准确定位提供帮助。裂解技术的多功能性实现了最复杂的PTMs的检测。

　　对于Bottom-Up的蛋白质组学实验，组合式质谱仪能通过改善蛋白质、PTM和肽的鉴定，为实验室提供更高的蛋白质组覆盖率，即使是低丰度蛋白质也能获得满意的结果。对于定量蛋白质组学，当采用诸如串联质谱标记的同位素标记方法时，更高的系统速度和灵敏度能增加可定量的肽的数目。

　　为代谢组学和代谢研究提供新的可能：

　　对于代谢组学、脂类组学和代谢的研究，仪器能提供超高质量的HCD和MSn谱图，为可靠的代谢物鉴定提供更丰富的结构信息。相较于以前的系统，其超高的灵敏度能检测到更多的代谢物和其它重要的样品组分。该系统的高分辨率特别适合于诸如脂类分析时所需的同位素物质的测定。